… vai levar sempre a um apuramento de mais vagas negativas que positivas.

Porque a aplicação considera o número de alunos, a carga letiva da disciplina e faz uma divisão pelo número máximo de alunos por turma para o apuramento final.

Mas no fim existe sempre a possibilidade de fazer esse cálculo manual e alterar a proposta que surge automaticamente.

Eu como gosto mais das minhas contas, evitarei, sempre que possível, este cálculo automático.